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食品科學與工程的發(fā)展同化學工程、生物工程緊密相關，她的發(fā)展方向是新包裝手段和裝備改善食品包裝技術，提高食品保藏性能和貨架壽命；完善蒸煮技術、無菌包裝技術；研究合理的節(jié)能裝置以降低冷凍食品的成本；食品工程單元操作的較優(yōu)化、自動化及計算機的應用。食品科學與工程雖然是年輕的技術學科，但她在現(xiàn)代社會早已成為經濟發(fā)展、文明程度提高的主要標志。未來的發(fā)展趨勢是借鑒基因技術的發(fā)展成果，研制出營養(yǎng)更加豐富、味道更加鮮美、保質期更科學的食品。根據(jù)轉基因食品中含有轉基因源為標準可分為如下三種不同類型：（1）食品本身不含轉基因的轉基因食品，是指食品盡管來源于轉基因生物，但其產品本身并不會有任何轉移來的基因。（2）轉基因食品中確實含有轉基因成分，但在加工過程中其特性已發(fā)生了改變，轉移來的活性的基因不復存在于轉基因食品中的轉基因食品。（3）轉基因食品中確實帶有活性的基因成分，人們食用這種轉基因生物或食品后，轉移來的基因和生物本身固有的基因均會被人體消化吸收的轉基因食品。
